موضوع آخرمهم متعلق بالأحافير هو الوقود الأحفوري. منذ ملايين السنين، العديد من النباتات والحيوانات ماتت و غرقت في قاع المحيط أو سقطت وماتت في مستنقعات ضخمة. ولم تصبح أحافير ولكنها فسدت وتحللت فقط . بعد فترة طويلة من الزمن، غطت طبقات وطبقات من الطين والرمل والحجر النباتات والحيوانات المتحللة وتعرضها للحرارة حتى أصبحت الرواسب من الوقود الأحفوري في طبقات الصخور الرسوبية. اعتمادا على أنواع النباتات والحيوانات التي دفنت، ودرجة الحرارة والضغط، وتشكلت لأنواع مختلفة من الوقود الأحفوري - مثل البترول (اسم آخر للنفط) والفحم، والغاز الطبيعي.
البترول والغاز الطبيعي والفحم هي ثلاثة أنواع من الوقود الأحفوري. انها جميعا موارد قيمة للغاية. على الرغم من أنها تسمى بالوقود الأحفوري، فهي ليست حقا أحافير. يتم تكوين هذه الأنواع من الوقود من النباتات والحيوانات الميتة التي عاشت منذ فترة طويلة جداً فقط .
الشمس هي المصدر الرئيسي للطاقة لجميع أنواع الوقود الأحفوري. النباتات والحيوانات تحصل على الطاقة من الشمس وتصبح هذه الطاقة هي الطاقة في الوقود الأحفوري. اليوم، عمال المناجم ورجال النفط يستخدمون المثاقب الكبيرة والمعدات الثقيلة الأخرى للتنقيب او الحفر في القشرة الأرضية للعثور على الوقود الأحفوري. وعادة يتم العثور على الغاز الطبيعي بالقرب من حقول النفط التي تم إنشاؤها في ظل ظروف مماثلة. النفط والغاز، والفحم يمكن تحويلها إلى كهرباء - وهي شكل آخر من أشكال الطاقة. ويمكن أن يصنع النفط البنزين لتشغيل سياراتنا. نستخدم الوقود الأحفوري كل يوم، ولكن عملية تشكيلها داخل الأرض يستغرق وقتا طويلا - ملايين السنين. وهذا يعني أن هذه الموارد هي غير متجددة : لا يمكن استبدالها ما دامت قد استخدمت.